بررسی خصوصیات چند شکلی های تک نوکلئوتیدی در ناحیه َ5 ژن لاکتوفرین در گاوهای بومی و هلشتاین ایران

زمینه مطالعه: لاکتوفرین، گلیکوپروتیین متصل شونده به آهن، دارای نقش های فیزیولوژیکی متعددی می باشد که مهمترین آنها خواص آنتی میکروبی است. از این رو ژن کد کننده این پروتیین می تواند به عنوان ژن کاندیدایی در مقاومت به بیماری ورم پستان در نظر گرفته شود. هدف: بررسی ناحیه َ5 ژن لاکتوفرین گاو در نمونه های بومی و هلشتاین با استفاده از روش pcr-sscp و تعیین توالی می باشد. روش کار: برای این منظور از تعداد 50 نمونه گاو بومی و 50 نمونه گاو هلشتاین ماده ژنتیکی استخراج گردید. آغازگرهای لازم جهت تکثیر بخشی از ناحیه َ5 طراحی، و قطعه مورد نظر توسط روش sscp تعیین ژنوتیپ شد. سپس هر الگوی مشاهده شده تعیین توالی گردید و همترازی توالی ها جهت شناسایی چند شکلی های تک نـوکلئـوتیـدی صـورت گـرفت. همچنین، تجزیه و تحلیل این سیلیکو (in silico) جهت تأثیر چند شکلی های تک نوکلئوتیدی برجایگاه اتصال فاکتورهای رونویسی در ناحیه تکثیر شده صورت گرفت. نتایج: در این تحقیق، در تمام نمونه های مورد بررسی 3 الگوی واضح ) sscp a، b و (c برای قطعه تکثیر شده مشاهده شد که در گاو های بومی تنها هاپلوتیپ c آشکار گردید. تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی توالی ها نشان داد که جایگزینی t با g در جایگاه 602 منجر به ایجاد جایگاه اتصالی برای فاکتور رونویسی 1aml- گردید. از طرف دیگر، جایگزینی t با c در جایگاه 586 جایگاه اتصال فاکتور رونویسی 1aml- را منسوخ می کند. نتیجه گیری نهایی: بنابراین، جهت استفاده از ژن لاکتوفرین به عنوان نشانگر مقاومت به بیماری ورم پستان در گاوهای شیری، بررسی این چند شکلی ها از نظر تأثیر بر فرآیند رونویسی ژن، همچنین ارتباط آن با تعداد سلول های سوماتیکی شیر امری ضروری می باشد.